Dune, réduite en cendres sous les attaques brutales de la Déesse Mère, ne voit cependant pas sa légende s'éteindre.
Les forces de l'ancien empire sont presque entièrement vaincues par la Déesse Mère, seule la Sororité continue la lutte. Elles sont au bord de la destruction et ne peuvent se replier que sur la dernière planète, le Temple, mais il reste un espoir : le guerrier mort-vivant Duncan, Mebara qui a trahi la Déesse Mère, Shiana, descendante des Atréides qui peut contrôler les vers des sables, et le dernier héritage de Dune – le dernier ver des sables de tout l'univers...
Alors que le Temple commence à être transformé en un second Dune, la Sororité lance une contre-attaque désespérée...